新一轮机构调整将三大基本医保体系整合，拟改变过去由人社部与国家卫生和计划生育委员会（下称卫计委）分管局面，改由同一部门管理。尽管医保经办已确定交由人社部门统一协调，但医保政策制定权归属，至今仍无定论。
据财新记者了解，目前人社部、卫计委均已分别召开研讨会，就医保管理权归属征询专家意见。双方均有意接过医保管理权，而负责机构职能调整的中编办亦在考量阶段，结果即将落定。
此前，城镇职工医保、城镇居民医保由人社部主管，覆盖8亿农村户籍人口的新农合则由卫计委主管。业内对此次整合存在多种意见。不乏卫生系统内部人士，如北京市卫生局副局长钟东波公开对媒体表示，三大医保体系交由卫生部门整合，可以为下一步制度演变奠定组织基础，但也有学者提出，哪个部门接管并无实质区别，关键在于医保经办机构“管办分开”、独立运营。
日前，卫计委新农合研究中心常务副主任汪早立就此问题对财新记者表示，医保制度在医改中具有基础性作用，是推动医改各项工作开展的枢纽，如交由卫生部管理，将成为推动改革的一项“抓手”，“否则医改工作无法推动。”
汪早立认为，过去四年新医改，对缓解“看病难、看病贵”的实质作用有限，存在基层医疗机构门可罗雀、大医院过于拥挤的现状，原因之一即在于医保制度未能做出相应的调整，不同级别的医疗机构报销待遇相近，不能通过经济手段将患者留在基层，形成转诊机制，“从这个角度说，卫生部门比人社部门更清楚每一级医疗机构应该承担怎样的责任。”
此外，汪早立也不认同此前人社部通过总额控制对医保基金控费的做法，认为有失精细，“如果交给卫生部门管理，会在控费的同时兼顾医疗服务质量，更好地推进公立医院分配和管理制度改革，调动医生控费的积极性。”
不过，更多学者担忧的是，在公立医院尚且管办不分的情况下，再将医保管理权交给卫计委，或将导致医疗费用快速上涨，医保基金安全堪虞。财新记者检索资料显示，在国际经验中，发达国家也只有在公立医疗机构管办分开的情况下，才会将医疗保险和医疗机构交由同一部门管理。
“基本医保归哪个部门管理，其实没有明显差异。对一般参保人而言，两个部门管理的差别，体现在医保基金的使用效率和对医院浪费医保资金行为的管理上，作用是通过医生和医院的行为传递给患者的。”对外经济贸易大学保险经济学院教授于保荣说，关键是建立独立运行的医保经办机构，在市场化机制下，对医院进行契约管理。
于保荣分析，公立医院走向独立的法人化治理是大势所趋，在基本医保由独立经办机构运作的情况下，具体报销结算在各级医疗机构间进行，从行政成本角度或从管理的宏观效率来看，并无明显差别， “管理手段应该是市场经济下的经济激励，属于契约管理，两个机构间也应该是平等的市场主体关系。”
于保荣特别指出，在单独的医保经办机构体制下，哪个部门来管都不会有明显差别，“如果有管理效率不高的现象，也是由大的行政体制造成的，而非某个部门的问题。”
