咽炎、支气管炎及上呼吸道感染需根据病因和症状选用药物，包括抗生素、抗病毒药、解热镇痛药及止咳化痰药等。
细菌性感染常采用抗生素治疗，例如β-内酰胺类药物可抑制细胞壁合成，大环内酯类药物对非典型病原体有效。使用前应通过血常规等检查确认感染性质，避免盲目用药。病毒性感染早期应用神经氨酸酶抑制剂可缩短病程，某些药物对特定病毒效果较好。淋巴细胞比例升高可作为辅助判断依据。
发热或咽痛可使用解热镇痛药物，这类药品能有效缓解不适。儿童用药需依据体重调整，消化道溃疡者慎用。体温明显升高时建议服用，但需控制使用时长。咳嗽伴有痰液黏稠者可选用分解黏蛋白药物，干咳则适用中枢性镇咳药。若存在支气管痉挛，可联合支气管扩张剂改善症状。
部分中成药对病毒性感染具有广谱抑制作用，或能舒张支气管。中药强调辨证施治，需区分风寒与风热证型选用。
治疗期间应保证充足饮水和维生素摄入，维持适宜环境湿度并避免呼吸道刺激。出现持续高热、呼吸频率加快或血氧水平下降等情况须及时就医。恢复阶段可进行温和锻炼以增强功能，但应防止过度运动引发并发症。合理用药结合日常护理有助于促进康复。
